按照2009版合同里面的專用條款約定，總包施工后必須及時將遺留臨時設施、生活垃圾的拆除與清理干凈，若需要恢復綠化原貌的，還必須無條件的恢復好。

針對你提出的問題，你還是需要看看你們工程的承包合同是怎么約定的，有些建設方也不一定會扣減你總包單位的費用，因為有時建設方為了提前達到一些其他的效果，可能會委托其他專業單位對其拆除，費用有的就建設方自己承擔了。

現有個工程總包完工后沒有把施工時的臨時設施拆除及生活垃圾清理出場，甲方把此部分拆除及清理給了該工程的另個分包單位去弄。請問此部分費用甲方是否需要在總包那里扣除，扣除費用支付給分包。如果要扣除，這部分費用是按實際扣除，還是按百分比%扣除，有沒有關于這項費用的規定。

讓甲方與總包溝通，扣點錢當補償。