這樣看合同的約定了，是總價合同，還是單價合同的

如果工程合同沒有相關約定我認為應該是

結算時清單量要按實際計算的量調整，綜合單價還是投標報價時的綜合單價。

不能只看兩者相差120000元， 應該看當時報的綜合單價是否合理。第一，如果當時投標報的綜合單價較高，那就這一項來說，那投標方肯定沒虧；第二，清單投標報價策略里面有一條就是“不平衡報價”，投標方報60元肯定是從單價或總價上覺得合理才這么報價的。

實際挖土方量是12000m3，按清單計價規則算出的清單工程量應該是6000m3，但招標時清單工程量是8000m3，組價時，投標方按1.5的含量計算，不考慮取費因素，定額挖1m3土40元，清單綜合單價就是60元/m3，清單工程量反映的8000 m3土方合同金額合計是480000元，結算時按清單計算規則，清單工程量變成了6000 m3，清單綜合單價不變，清單工程量反映的結算土方合計6000*60=360000元，就是工程量上的一個小小手腳，結算總價差了25%計120000元，這該怎么辦？

你的問題是招標方玩弄的一個小手腳，清單編制人事先知道土方清單量是6000m3，但編制清單時故意寫了8000m3，因為清單量結算時可調整，偏差超過5%的量可以調整，8000m3就要調整回到6000m3，清單的綜合單價是不可以調整的，所以出現了造價上的差額。類似這種情況很多，所以要求投標人仔細核量，發現問題及時糾偏。