工程簽證與變更主要在以下三個方面存在區別：

1、內容：工程簽證主要涉及在施工過程中實際發生的、圖紙或合同以外的內容，這些通常是原本預算中未考慮但可能產生工程費用的內容，需要進行現場記錄并形成文字性文件。而工程變更則是對合同中原有的工作內容進行修改、追加或取消某一項工作，這通常涉及到對原設計圖紙的修正、設計補充或變更。

2、法律效力：工程簽證是工程承發包雙方互相書面確認的憑證，它成為工程結算或最終結算增減工程造價的依據，具有法律效力。而工程變更則是項目干系人由于各種原因要求對項目計劃進行修改或重新規劃的行為，它本身并不直接產生法律效力，但可能導致合同內容的變更。

3、主體：工程簽證是承發包人雙方協商一致的結果，屬于雙方法律行為。工程變更則可以是發包人（如設計院或業主）根據需要對工程項目進行的調整和修改，也可以是發包人提出、經設計院簽字認可后再由發包人下發的變更。