如圖所示，想請教各位師傅，如圖三所示，設計院出設計變更前的頂棚做法為保溫頂棚，投標綜合單價在66.84元/平米，變更后取消了頂棚的保溫做法，改為普通膩子，然后我在計價文件中將保溫做法的定額子目刪除后改套普通膩子，綜合單價降到了17.36元/平米，該清單項目綜合合價減少近5萬元，所以我有如下幾個問題，

1：做法修改導致的綜合單價變化是否是用我這種辦法直接在計價文件中修改定額子目就可以了？我們施工現場是按修改后的做法來施工的，那么我需要單獨做簽證么？還是說直接到了結算階段按這個設計變更文件就這樣組價就可以了？是不是結算的時候就按這個變更后的做法在軟件里把定額子目改了就可以了？還是說在他下了設計變更后需要在施工階段找甲方確認這個新的綜合單價？

2；這一項變更直接導致合價減少5萬多元，然后這是一棟樓，整個項目有27棟樓，直接導致我們的合同總價減少了一百多萬元，作為施工方很吃虧，我們有沒有什么辦法可以來應對或者減少損失呢？

3，這種取消保溫做法的變更是否是甲方認為操作，在后期的節能驗收環節以及后續的工程保修階段會不會出問題呢？如果因保溫取消導致的節能驗收或工程保修出現問題又是誰的責任呢？

打字太多，還請各位師傅不吝賜教悉心指點，萬分感謝