1、工程合同計價稅率為11%，結算審計報告的稅率也是11%，但是等工程審計完成后，稅率已經調整為9%，現在施工單位辦理尾款時開不出11%票，只能開9%的票，計價稅率11%>實際稅率9%。

這種情況要雙方協商，最好的處理辦法是以稅前價來定造價，前期開過11%的票的按11%，后期開9%的票的工程款以稅前價來定開票額度。

2、還有一種是工程合同計價稅率9%，但是因雙方簽訂時沒注意到施工方為小額納稅人，工程結算因施工方只能開3%的增值稅專用發票，計價稅率9%>實際稅率3%。

這種情況，不僅僅看稅率不同，計價體系也不同。按9%計稅時，定額人、材、機是除稅價；按3%計稅時，定額中的人、材、機應該是含稅價，總體來說造價差別沒那么大。雙方可以協調是按3%來重新組價還是按直接按現有辦法計價。